Penyiapan, penanganan, atau penyimpanan sampel pada kondisi atmosfer dapat meningkatkan penumpukan hidrokarbon pada spesimen, dan di bawah pengaruh berkas elektron, hidrokarbon ini dapat membentuk lapisan tebal pada permukaan. Membersihkan permukaan sampel dengan ZONESEMⅡ menghilangkan hidrokarbon dan mengurangi molekul yang tersedia untuk kontaminasi akibat berkas. Mencegah kontaminasi dari permukaan spesimen sangat penting untuk pengamatan yang sebenarnya dalam mikroskopi elektron.